景觀水處理中的沿岸帶是恢復水生植被的核心區，也是藍藻水華聚集的場所。藍藻水華能降低湖水的透光率，減少水下可供水生植物利用的光資源；同時藍藻能黏附在水生植物表面，不僅會嚴重妨礙光合作用和水生植物與湖水間的物質交換，還能招致微生物的大量繁殖，嚴重時會引起水生植物的腐爛死亡。
藍藻水化的控制可以采取兩種方式：一種是全湖性控制，即對全湖藍藻總量進行控制，防止在沿岸帶形成藍藻聚集，在小型湖泊中比較容易實現；另一種是局部湖區的藍藻控制，利用圍隔技術將需要恢復水生植被的湖區與大湖面隔離開來，在隔離區內控制藍藻，在大型湖泊中采取這種方式比較合理。
景觀水處理中藍藻的控制技術通過有機機梭捕撈、生物控制、藥物控制等，如何經濟有效地使用這些技術可視具體情況確定，比如在娛樂型城市景觀水處理中采用藥物控制可能會更快捷，但必須保證所使用的藥物不會妨礙水生植物的生長和水生動物的生存。
