目前世界各地有8000多家使用紫外線消毒器水處理工藝的城市污水處理廠和自來水廠，而這一數據也在不斷刷新，這與紫外消毒技術的自身優勢是分不開的。在我國的一些水廠已經大部分開始接納紫外線消毒器消毒技術，我國的紫外線消毒器殺菌消毒技術處于快速發展階段。
一直以來，在幾種常見消毒方式中，人們習慣于將氯消毒和紫外消毒進行比較。據業內人士分析，傳統的氯消毒的成本一般是0.5～1分錢/噸水，而紫外的成本也就１分錢/噸水左右，有一定的可比性。而隨著紫外燈管的壽命的延長和設備的不斷優化，成本基本不再是困擾紫外線殺菌器消毒應用的問題了。
紫外線消毒器能較經濟有效地解決兩蟲（隱孢子蟲、賈第蟲）問題。國外一般采用生飲水，水中隱孢子蟲的存在、人們對水安全認識的提高以及有關水質標準的制定成為近幾年紫外線殺菌器消毒在市政飲用水廠得到大規模應用的主要原因（紫外可以殺死隱孢子蟲），中國目前新的水質標準也已將隱孢子蟲和賈第蟲列入。
此外，紫外消毒在控制消毒副產物和保證安全性方面有較大的優勢。消毒副產物對人體的危害比較大，如三鹵甲烷、鹵乙酸以及嗅酸鹽等是致癌物，而事實上水中實際存在的消毒副產物比標準中規定的副產物要多很多。
在世界范圍內，紫外在水處理領域應用的歷史很早，70年代以前由于紫外消毒技術不夠成熟限制了紫外線的大規模應用。80年代后紫外逐漸成熟并在污水和自來水領域得到較快地應用，如規模為820萬m3／d的紐約自來水廠，因為水源水質非常好，只簡單經過沉淀、消毒后就向用戶供水了。93年美國城市隱孢子蟲爆發，因為沒有過濾工藝，紐約自來水公司經過經濟對比，選擇了紫外線殺菌器消毒來應對隱孢子蟲和預期更為嚴格的水質標準。除了紐約，華盛頓特區還有一個規模為100萬m3／d的水廠采用了紫外線消毒器消毒。
我國的一些水廠已經開始接納紫外線消毒技術，我國的紫外線消毒器殺菌消毒技術處于快速發展階段，許多企業和單位對紫外線消毒技術認識不足甚至存在一些誤區，對這一技術的了解和掌握不夠系統和全面，特別是有些購買方在不了解紫外消毒技術和設備的情況下，過于追求降低紫外線消毒器成本而忽視了設備的性能和質量問題，設備運行和使用可能會出現一些問題，讓一個很好的技術在中國失去用戶的信心。
在目前眾多消毒技術當中，沒有一種理想的單一消毒手段，任何技術都有優缺點，如：氯消毒的安全性問題主要體現在消毒副產物和使用環節中的安全性以及無法有效控制隱孢子蟲等病原體、臭氧存在嗅酸鹽問題以及經濟性問題、紫外線殺菌器雖然公認在所有消毒手段中對微生物具有廣譜性，可以很經濟范圍內控制隱孢子蟲但對線病毒消毒不是很經濟，另外在飲用水處理中無法保證管網生物穩定性等。
應該結合不同的水質、水源條件，采取多屏障的消毒措施，來保證飲用水消毒的安全性。將多種消毒手段結合起來使用，取長補短。另外紫外線消毒器消毒+雙氧水的深度氧化技術對微污染控制包括藻毒素等有很好的效果，而且在北美、歐洲等地已經有很成功的工程案例。
鑒于紫外消毒自身的特點，加上國內水質標準的不斷提高，紫外線消毒已經贏得了一席之地。紫外線殺菌器消毒技術應用比較廣泛，城市污水、市政飲用水、工業/商業用水、住宅區生活用水、水中環境污染物處理等領域，而且隨著對消毒性能、節能、運行成本上的不斷深入研究和創新，紫外線消毒器消毒會有更廣泛的應用。
